农业部环境保护科研监测所是我国最早建立的、专门从事农业环境保护研究的国家级科研事业单位。
该所设有农业环境质量监督检验测试中心、农业部农业环境与农产品安全重点开放实验室、农业部环境监测总站、农业环境信息中心及
生态工程研究室，中国农业生态环境保护协会挂靠在该所。该所也是我国农业环境保护工作领域的科学研究中心、监测（网络）中心、信息交流中心和人才培训中心。第一任所长买永彬先生出席了联合国第一次人类环境会议，会议开幕日6月5日被确定为“世界环境日”。
全所现有在职职工76人，其中科研人员62人，在科研人员中，高级研究人员32人。拥有ICP-MS、气/质联用仪、气谱、液谱、原子吸收等大中型精密仪器40多台件，各类书刊25万余册，固定资产总值2000多万元。
该所1979年建立，建所20多年来，共承担农业部、科技部等部门各类科研项目250多项，获国家和省、部级奖励59项，在国内外学术刊物发表论文700余篇，出版专著35部。工作范围几乎包含了我国农业环境保护领域的各个方面，其优势领域主要有：农业环境污染与防治，生态农业研究与建设，农业环境监测，基本农田保护，无公害农产品、绿色食品、农产品污染防治，农业环境影响评价，农药污染监测与控制，化肥污染控制，农业废弃物综合利用，污水回灌再生利用，农业亲缘野生生物保护，农业环境污染事故技术仲裁，标准物质研制和环境标准制定等方面。
该所与UNDP、UNIDO、GEF、UN/FAO、世界银行、美国、德国、英国、加拿大、日本、澳大利亚等多个国际组织、外国政府、民间组织具有良好的长期合作关系。
建所以来，承担各类科研课题、任务234项，获得国家及省部级科技成果59项。1996年获农业部“八五”全国农业科研开发综合能力“百强研究所”称号。出版《农业环境与发展》及《农业环境学报》。
该所农业环境保护事业与我国农业环境保护事业的长足发展息息相关，从最早研究工业“三废”对农业环境的影响逐步转变为研究农业自身活动对农业环境的影响，近年研究表明，农业发展包括农业投入品的不合理使用、农业技术不合理应用与推广、农业生产过程中一些不良行为（如过载放牧）的发生等，对生态环境具有很大的破坏作用，进入WTO后，这些问题将越来越突出，我国农业生态环境保护工作任重而道远。
